How does stochasticity in learning impact the accumulation of knowledge and the evolution of learning?
この論文は、学習における確率的な変動が個体間の知識レベルのばらつきを生み出し、自然選択を通じて知識の蓄積を促進するとともに、社会学習への投資増加や親からの学習、さらには学習そのものの確率的性質の進化を促すことを数学モデルにより示しています。
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evolutionary biology
464 件の論文
charisma: An R package to perform reproducible color characterization of digital images for biological studies
この論文は、生物学的研究において大規模な画像データベースを対象とした再現性のある色分類を可能にするRパッケージ「charisma」を開発し、タンジャー類の色彩進化の分析を通じてその有効性と専門的な色分類との整合性を示したものである。
Parallel adaptive responses to postponed reproduction increase lifespan and immune defense
ショウジョウバエを用いた大規模な実験進化研究により、生殖の遅延を選択圧として与えることで寿命の延長だけでなく、発育遅延、産卵数の増加、ストレス耐性、免疫防御の強化といった広範な生理的変化が引き起こされ、その遺伝的基盤は従来の老化や免疫経路ではなく神経発達や形態形成に関連する多数の遺伝子に依存していることが明らかになりました。
The not-so-great speciator: Systematics and species limits in a rapid radiation, the Asiatic white-eye complex (Zosterops spp.)
本論文は、ゲノム規模のSNPデータや形態測定などを統合的に解析することで、アジアのメジロ属（Zosterops）の系統関係を解明し、フィリピンや日本などにおける急速な種分化の過程や、現時点では独立した種とはみなしにくい系統分岐の存在、および特定の島嶼における形態進化の兆候を明らかにしたものである。
Phylogenomic analyses of the Austral podocarps (Podocarpus: Podocarpaceae) reveals unlikely hybrid ancestry of a New Zealand species
オーストラリア南半球のツガ属（Podocarpus）の系統ゲノム解析により、ニュージーランドの種 Podocarpus nivalis が、オーストラリア由来の P. lawrencei とニュージーランド固有の P. laetus の交雑によって生じたハイブリッド種であることが明らかになり、この交雑が創始者効果の緩和や寒冷環境への適応に寄与した可能性が示唆されました。
Pleiotropy and repeated mutation drove convergent domestication of grain amaranth
この研究は、ヒトの意図的な選抜ではなく、種子の色と休眠性の間の多面性（プレオトロピー）が複数の独立した変異を通じてアワノビエの収獲適応を駆動し、人類が変容させた環境への植物の適応メカニズムを解明したことを示しています。
Cytonuclear Conflict and Reticulate Evolution in the Morelloid Clade (Solanum, Solanaceae): Insights from Genome Skimming and Network Phylogenomics
本研究は、ゲノムスキミングとネットワーク系統解析を用いて、ナス属のモレロイドクレードにおいて核と葉緑体の系統的不一致が不完全な系統分岐ではなく、特にアフリカの多倍体やパンアメリカンの二倍体系統間で繰り返された葉緑体の獲得（chloroplast capture）を含む網目状進化によって引き起こされたことを明らかにした。
Determinants of chromosomal rearrangements in holocentric Leptidea butterflies
本研究は、9 つの染色体レベルゲノム配列と 138 個体の全ゲノム再配列データを用いて、ホロセント性染色体を持つチョウの属 Leptidea における染色体再編成の決定要因を解析し、その再編成がタンパク質コード遺伝子から欠乏し、特に衛星 DNA、リボソーム DNA、セグメンタル重複のクラスターと強く関連していることを明らかにしました。
Phenotypic and Genomic Evidence of Adaptive Tracking in Thermal Tolerance of Wild Populations of an Invasive Drosophila.
この論文は、侵入種ショウジョウバエ（Drosophila suzukii）において、多遺伝子性の耐熱性が季節変動に追従して進化する一方で、その遺伝的シグナルは寡遺伝子形質に比べて弱く検出されにくいことを示し、これがその侵入成功に寄与していることを明らかにしたものである。
TRACKING EVOLUTIONARY COSTS OF IMMUNE ADAPTATION AGAINST SINGLE VERSUS COINFECTING PATHOGENS
本論文は、単一または複数の病原体に対する進化実験を通じて、トウミツバエの免疫適応が直接的な生存や繁殖のトレードオフを引き起こすとは限らず、むしろ生存条件や資源の制約に依存した形で表現型が変化し、内部免疫と外部防御の間のトレードオフや条件依存的なコストが重要であることを示している。
Ploidy reorganizes ionomic composition across metabolically active and mineralized tissues.
ニュージーランドのヌマエビ（Potamopyrgus antipodarum）を用いた研究により、ゲノムサイズ（倍数性）の変化は単一の元素需要を変えるのではなく、代謝活性組織と鉱物化組織全体での元素配分を再編成し、生物の化学的構成をシステムレベルで再構築することが示されました。
Coding sequence clustering universally predicts fine- and coarse-scale chromatin compartment landscapes
本論文は、247 種にわたる解析を通じて、GC 含量や反復配列など従来の要因ではなく、コーディング配列（CDS）の密度分布が、種を超えて保存され、核内コンパートメント構造を決定する普遍的かつ根本的な原理であることを明らかにしました。
Calcareous sponge cell atlas provides support to homology between sponge and eumetazoan body plans
単細胞トランスクリプトーム解析に基づく細胞アトラスの作成により、海綿動物の体層が後生動物の胚葉と相同であるというヘッケルの仮説が支持され、海綿動物が単細胞原生生物と複雑な動物の間の進化の中間段階を代表することが示されました。
Evolutionarily Optimal Phage Life-History Traits: Burst Size vs. Lysis Time
この論文は、ウイルスと微生物の比率に基づく新しい動的モデルを用いて、環境条件や人為的介入がファージの裂解時間やバーストサイズといった生活史形質の進化的最適化にどのように影響するかを予測し、これらの形質が環境に応じて予測可能であることを示しています。
Single capsid mutations modulating phage adsorption, persistence, and plaque morphology shape evolutionary trajectories in {Phi}X174
本研究は、ΦX174 噬菌体の伝播条件（継代間隔）が単一のカプシド変異を介して吸着速度や環境耐性などの形質をどのように変化させ、異なる進化的軌道を生み出すかを、実験進化と数理モデルを用いて解明したものである。
The persistence and loss of hard selective sweeps amid admixture in ancient Eurasians
この研究は、ドメイン適応型ニューラルネットワークを用いて古代ユーラシア人のゲノムを解析し、交雑や遺伝的浮動といった強い圧力にもかかわらず、色素沈着や神経機能などに関わる多くの「ハード選択的スイープ」が過去 7000 年にわたって維持されてきたことを明らかにしました。
The biogeography of the stripped Venus clam, Chamelea gallina, in the Mediterranean Sea indicates limited gene flow and shows evidence of local adaptation.
地中海の縞貝（Chamelea gallina）のゲノム解析により、中立マーカーでは高い遺伝子流動が示唆される一方で、適応的変異は環境勾配や生物地理的障壁に応じて明確な集団構造と局所適応を生み出しており、持続可能な漁業管理には中立変異だけでなく適応的ゲノム情報の統合が不可欠であることが示されました。
Divergent Biological Consequences of APOE Isoforms Across Industrialized and Non-Industrial Environments
この研究は、アフリカとマレーシアの先住民集団を対象に、APOE ε4 遺伝子型が工業化された環境と非工業化環境で異なる生物学的影響（コレステロール、免疫、生殖）をもたらすことを示し、特に非工業化環境でもその利益が普遍的ではなく、局所的な環境変数がコストと便益を決定づけることを明らかにした。
The gene ivory:mir-193 controls scale type differentiation in Heliconius butterflies
CRISPR 技術と単一核 RNA シーケンシングを用いた研究により、Heliconius 属のチョウにおいて、遺伝子 ivory と mir-193 が黒色鱗の分化を制御し、mir-193 が転写終止因子として機能することで鱗の運命決定の多様性が生み出されていることが明らかになりました。
Taming the Genetic Fire: Transposable Element diversity across thermal environments in polychaetes
この研究は、多毛類のトランスポゾン（TE）多様性が熱環境の安定性と関連しており、不安定な環境では有害変異の蓄積を防ぐために多様性が抑制される一方で、DIRS 様要素など特定の例外を除き、環境ストレスによる TE の活性化とゲノム全体の突然変異率のバランスが維持されていることを示しています。